Następne kroki¶
Tłumaczenie wspomagane przez AI - dowiedz się więcej i zasugeruj ulepszenia
Jeszcze raz gratulujemy ukończenia kursu szkoleniowego Nextflow dla RNAseq i dziękujemy za wypełnienie naszej ankiety!
1. 3 najlepsze sposoby na rozwinięcie umiejętności Nextflow¶
Oto nasze trzy najważniejsze rekomendacje dotyczące kolejnych kroków na podstawie kursu, który właśnie ukończyłeś.
1.1. Zastosuj Nextflow do innych przypadków użycia w analizie naukowej¶
Sprawdź stronę Nextflow for Science, aby znaleźć listę innych krótkich, samodzielnych kursów, które pokazują, jak zastosować podstawowe koncepcje i mechanizmy przedstawione w Hello Nextflow do typowych przypadków użycia w analizie naukowej.
Jeśli nie widzisz Swojej dziedziny reprezentowanej przez odpowiedni przypadek użycia, daj nam znać na forum społeczności, abyśmy mogli dodać ją do naszej listy rozwojowej.
1.2. Rozpocznij pracę z nf-core¶
nf-core to światowa inicjatywa współpracy mająca na celu opracowanie znormalizowanych pipeline'ów open-source dla szerokiego zakresu zastosowań w badaniach naukowych. Projekt obejmuje ponad 100 pipeline'ów dostępnych do użycia od razu oraz znacznie ponad 1400 modułów procesów, które można zintegrować z własnymi projektami, a także bogaty zestaw narzędzi deweloperskich.
Kurs szkoleniowy Hello nf-core wprowadzi Cię w pipeline'y kuratorowane przez społeczność nf-core oraz framework deweloperski. Narzędzia te pomagają tworzyć powtarzalne, skalowalne i znormalizowane workflow'y. Nauczysz się używać istniejących pipeline'ów nf-core, przyczyniać się do ich rozwoju, a nawet budować własne, wspierane przez najlepsze praktyki i prężną społeczność. Jeśli jesteś gotowy, aby zastosować Swoje umiejętności Nextflow w rzeczywistych projektach, to idealny następny krok.
1.3. Opanuj bardziej zaawansowane funkcje Nextflow¶
W kursach Hello celowo utrzymujemy niski poziom złożoności technicznej, aby nie przeciążać Cię informacjami, które nie są potrzebne do rozpoczęcia pracy z Nextflow. W miarę postępów w pracy będziesz chciał nauczyć się, jak używać pełnego zestawu funkcji i mocy Nextflow.
W tym celu obecnie pracujemy nad kolekcją Side Quests, które mają być krótkimi, samodzielnymi kursami dogłębnie omawiającymi konkretne tematy, takie jak testowanie i obsługa metadanych.
2. Sprawdź Seqera Platform¶
Seqera Platform to najlepszy sposób na uruchamianie Nextflow w praktyce.
Jest to platforma w chmurze opracowana przez twórców Nextflow, którą możesz połączyć z własną infrastrukturą obliczeniową (lokalną, HPC lub chmurową), aby znacznie ułatwić uruchamianie i zarządzanie workflow'ami, a także zarządzać danymi i przeprowadzać analizy interaktywnie w środowisku chmurowym.
Warstwa darmowa (Free Tier) jest dostępna do bezpłatnego użytku dla wszystkich (z limitami użytkowania). Uprawnieni pracownicy akademiccy mogą uzyskać bezpłatny dostęp na poziomie Pro (bez ograniczeń użytkowania) poprzez Program Akademicki.
Zapoznaj się z tutorialami Seqera Platform, aby sprawdzić, czy może być to dla Ciebie przydatne.
To wszystko na razie!¶
Powodzenia na Twojej drodze z Nextflow i nie wahaj się dać nam znać na forum społeczności, co jeszcze moglibyśmy zrobić, aby pomóc.