Orientamento¶
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L'ambiente GitHub Codespaces contiene tutto il software, il codice e i dati necessari per seguire questo corso di formazione, quindi non è necessario installare nulla autonomamente. Tuttavia, è necessario un account (gratuito) per effettuare l'accesso, e dovrebbe dedicare alcuni minuti per familiarizzare con l'interfaccia.
Se non lo ha ancora fatto, segua questo link prima di proseguire.
Materiali forniti¶
Durante questo corso di formazione, lavoreremo nella directory side-quests/.
Questa directory contiene tutti i file di codice, i dati di test e i file accessori di cui avrà bisogno.
Si senta libero di esplorare il contenuto di questa directory; il modo più semplice per farlo è utilizzare l'explorer dei file sul lato sinistro dell'area di lavoro di GitHub Codespaces.
In alternativa, potete utilizzare il comando tree.
Durante il corso, utilizziamo l'output di tree per rappresentare la struttura e il contenuto delle directory in forma leggibile, talvolta con modifiche minori per maggiore chiarezza.
Qui generiamo un indice dei contenuti fino al secondo livello:
Se esegue questo comando all'interno di side-quests, dovrebbe vedere il seguente output:
.
├── metadata
├── nf-core
├── nf-test
├── solutions
├── splitting_and_grouping
└── workflows_of_workflows
Ecco un riepilogo di ciò che dovrebbe sapere per iniziare:
-
Ogni directory corrisponde a una side quest individuale. I loro contenuti sono dettagliati nella pagina della corrispondente side quest.
-
La directory
solutionscontiene gli script di workflow e/o modulo completati che risultano dall'esecuzione dei vari passaggi di ciascuna side quest. Sono destinati ad essere utilizzati come riferimento per verificare il suo lavoro e risolvere eventuali problemi.
Suggerimento
Se per qualsiasi motivo doveste uscire da questa directory, potete sempre eseguire questo comando per tornarvi:
Ora, per iniziare il corso, cliccate sulla freccia nell'angolo in basso a destra di questa pagina.