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1. Nextflow pour la Science

Traduction assistée par IA - en savoir plus et suggérer des améliorations

Il s'agit de cours qui démontrent comment appliquer les concepts et composants présentés dans le cours débutant Hello Nextflow à des cas d'usage scientifiques spécifiques. Chaque cours consiste en une série de modules de formation conçus pour aider les apprenant·es à développer progressivement leurs compétences.

Nextflow pour la Génomique

Apprenez à développer un pipeline de génomique avec Nextflow.

Il s'agit d'un cours destiné aux chercheur·euses qui souhaitent apprendre à développer leurs propres pipelines de génomique. Le cours utilise un cas d'usage d'appel de variants pour démontrer comment développer un pipeline de génomique simple mais fonctionnel.

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Nextflow pour le RNAseq

Apprenez à développer un pipeline pour le traitement de données RNAseq avec Nextflow.

Il s'agit d'un cours destiné aux chercheur·euses qui souhaitent apprendre à développer leurs propres pipelines RNAseq. Le cours utilise un cas d'usage de traitement de RNAseq en masse pour démontrer comment développer un pipeline RNAseq simple mais fonctionnel.

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Nextflow pour la Bio-imagerie

Apprenez à exécuter des pipelines pour des données d'imagerie avec Nextflow.

Il s'agit d'un cours destiné aux chercheur·euses qui souhaitent apprendre à exécuter et configurer des pipelines de bio-imagerie. Le cours utilise nf-core/molkart pour démontrer les modèles d'utilisation essentiels de Nextflow applicables à tout pipeline.

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