Nächste Schritte¶
KI-gestützte Übersetzung - mehr erfahren & Verbesserungen vorschlagen
Herzlichen Glückwunsch nochmal zum Abschluss des Nextflow For Genomics Trainingskurses und vielen Dank für das Ausfüllen unserer Umfrage!
1. Die 3 besten Wege, um deine Nextflow-Kenntnisse zu verbessern¶
Hier sind unsere drei wichtigsten Empfehlungen, was du als Nächstes tun kannst, basierend auf dem Kurs, den du gerade abgeschlossen hast.
1.1. Wende Nextflow auf andere wissenschaftliche Anwendungsfälle an¶
Schau dir die Seite Nextflow for Science an, um eine Liste weiterer kurzer eigenständiger Kurse zu finden, die zeigen, wie du die grundlegenden Konzepte und Mechanismen aus Hello Nextflow auf gängige wissenschaftliche Anwendungsfälle anwenden kannst.
Falls du deinen Bereich nicht durch einen passenden Anwendungsfall vertreten siehst, lass es uns im Community-Forum wissen, damit wir ihn zu unserer Entwicklungsliste hinzufügen können.
1.2. Starte mit nf-core¶
nf-core ist eine weltweite kollaborative Initiative zur Entwicklung standardisierter Open-Source-Pipelines für eine Vielzahl wissenschaftlicher Forschungsanwendungen. Das Projekt umfasst über 100 Pipelines, die sofort einsatzbereit sind, sowie weit über 1400 Prozessmodule, die du in deine eigenen Projekte integrieren kannst, sowie ein umfangreiches Set an Tools für die Entwicklung.
Der Trainingskurs Hello nf-core führt dich in die von der nf-core-Community betreuten Pipelines und das Entwicklungs-Framework ein, die dir helfen, reproduzierbare, skalierbare und standardisierte Workflows zu schreiben. Du lernst, wie du bestehende nf-core-Pipelines verwendest, zu ihrer Entwicklung beiträgst und sogar beginnst, deine eigenen zu erstellen – unterstützt durch Best Practices und eine lebendige Community. Wenn du bereit bist, deine Nextflow-Kenntnisse in realen Projekten anzuwenden, ist dies der perfekte nächste Schritt.
1.3. Beherrsche fortgeschrittenere Nextflow-Features¶
In den Hello-Kursen halten wir die technische Komplexität absichtlich niedrig, um dich nicht mit Informationen zu überlasten, die du für den Einstieg in Nextflow nicht benötigst. Wenn du mit deiner Arbeit fortfährst, wirst du lernen wollen, wie du das vollständige Feature-Set und die Leistungsfähigkeit von Nextflow nutzen kannst.
Zu diesem Zweck arbeiten wir derzeit an einer Sammlung von Side Quests, die als kurze eigenständige Kurse konzipiert sind und tief in spezifische Themen wie Testen und Metadaten-Handling eintauchen.
2. Schau dir Seqera Platform an¶
Seqera Platform ist der beste Weg, Nextflow in der Praxis zu nutzen.
Es ist eine cloudbasierte Plattform, die vom Nextflow-Entwicklungsteam erstellt wurde und die du mit deiner eigenen Compute-Infrastruktur (ob lokal, HPC oder Cloud) verbinden kannst, um das Starten und Verwalten deiner Workflows sowie das Verwalten deiner Daten und das interaktive Ausführen von Analysen in einer Cloud-Umgebung deutlich zu erleichtern.
Der Free Tier steht jedem kostenlos zur Verfügung (mit Nutzungskontingenten). Qualifizierte Akademiker können kostenlosen Zugang auf Pro-Ebene (ohne Nutzungsbeschränkungen) über das Academic Program erhalten.
Wirf einen Blick auf die Seqera Platform Tutorials, um zu sehen, ob dies für dich nützlich sein könnte.
Das war's für jetzt!¶
Viel Erfolg mit Nextflow! Zögere nicht, uns im Community-Forum mitzuteilen, was wir sonst noch tun könnten.