1. Nextflow für die Wissenschaft¶
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Dies sind Kurse, die zeigen, wie du die Konzepte und Komponenten aus dem Hello Nextflow Einsteigerkurs auf spezifische wissenschaftliche Anwendungsfälle anwenden kannst. Jeder Kurs besteht aus einer Reihe von Trainingsmodulen, die so gestaltet sind, dass Lernende ihre Fähigkeiten schrittweise aufbauen können.
Nextflow für Genomik
Lerne, eine Pipeline für Genomik in Nextflow zu entwickeln.
Dieser Kurs zeigt, wie eigene Genomik-Pipelines entwickelt werden können. Der Kurs verwendet einen Variant-Calling-Anwendungsfall, um zu demonstrieren, wie man eine einfache, aber funktionale Genomik-Pipeline entwickelt.
Nextflow für RNAseq
Lerne, eine Pipeline für RNAseq-Datenverarbeitung in Nextflow zu entwickeln.
Dieser Kurs zeigt, wie eigene RNAseq-Pipelines entwickelt werden können. Der Kurs verwendet einen Bulk-RNAseq-Verarbeitungs-Anwendungsfall, um zu demonstrieren, wie man eine einfache, aber funktionale RNAseq-Pipeline entwickelt.
Nextflow für Bioimaging
Lerne, Pipelines für Bilddaten in Nextflow auszuführen.
Dieser Kurs zeigt, wie Bioimaging-Pipelines ausgeführt und konfiguriert werden können. Der Kurs verwendet nf-core/molkart, um wesentliche Nextflow-Nutzungsmuster zu demonstrieren, die auf jede Pipeline anwendbar sind.
Lass uns wissen, welche anderen Bereiche und Anwendungsfälle du hier gerne behandelt sehen würdest, indem du im Training-Bereich des Community-Forums postest.